L'expérience du BEOPS s'est forgée grâce à diverses étapes professionnelles complémentaires. 

A titre d'exemple, avant la création du BEOPS, le responsable, Mathieu SARASA (Docteur en Comportement, Ecologie et Evolution, Université Toulouse 3) avait déjà réalisé plusieurs dizaines d'études. Durant ces expériences en lien avec des universités, des parcs naturels et des associations, il a abordé des problématiques d'écologie appliquée et fondamentale en France et à l'étranger. Les publications scientifiques de ces travaux ont essentiellement concerné les mammifères et les oiseaux, sur des sujets tels que les estimations d'abondance, l'écologie comportementale, le parasitisme, les épidémies, la dynamique des populations, la gestion des espèces sauvages ou les évaluations des statuts de conservation.

Pour le BEOPS, le concept d'équipe va souvent au-delà du cadre des établissements, car, pour de nombreuses études, des synergies entre professionnels complémentaires de différentes institutions s'avèrent nécessaires.